налогообложение при швейном производстве и розничной торговле

ООО, основной вид деятельности - производство, пошив детских изделий, дополнительный вид деятельности - оптово-розничная торговля. имеется цех (пошив детской одежды) и несколько розничных магазинов, в которых осуществляется продажа в том числе и продукции собственного производства. магазины отчитываются и платят налоги ЕНВД (по площади). каким образом должен отчитываться цех (заявление о переходе на УСН 6% есть)? перечисления по счету практически отсутвуют.